En América Central la integración regional es —al igual que en otras regiones del mundo— un imperativo político. Los países de la región enfrentan problemas sociales, políticos y económicos que sólo pueden ser superados en el contexto regional. Por ello, una de las prioridades estratégicas de la FES en América Central es el fomento de los procesos de integración regional. No por último debido a la experiencia europea, la Fundación tiene la convicción de que apoyando la integración regional contribuye no sólo a prevenir conflictos y a lograr una estabilidad política en el largo plazo, sino también a buscar soluciones políticas a los problemas más apremiantes así como a impulsar el desarrollo económico y social de la región.

El enfoque de trabajo de la FES comprende la moderación de debates nacionales que se basan en análisis y estudios sobre los progresos y los déficit de la integración política y económica. También, en la integración de esos análisis, estudios y debates nacionales en el nivel regional, y en la cooperación con las instituciones de la integración regional en América Central.